Analyse d'une séquence ADN
(faites parler une
séquence)
Après clonage d'un fragment d'un ADN d'une archaea hyperthermophile dans un plasmide, vous décidez de séquencer l'insert pour découvrir votre nouveau gène.
Voici la séquence:
Sequenceur.txt
A partir de ce fichier faite une recherche de similarité par un alignement global contre l'ensemble des séquences par l'intermédiare de BLASTn. (nucleotide contre banque nucléotide)
En jargon de laboratoire on dit "faire un Blast" ou même "blaster". Le test se fait avec les parametres standards en choisissant la banque de donnée nr (non redondante)
Que remarquez vous? Avez vous découvert un nouveau gène?
A partir de ce fichier faite une recherche de similarité par un alignement global contre l'ensemble des séquences par l'intermédiare de BLASTn. (nucleotide contre banque nucléotide)
En jargon de laboratoire on dit "faire un Blast" ou même "blaster". Le test se fait avec les parametres standards en choisissant la banque de donnée nr (non redondante)
Que remarquez vous? Avez vous découvert un nouveau gène?