Analyse d'une séquence ADN
Il faut trouver le cadre de lecture
ouvert de lecture (ORF Open Reading Frame) codant votre
protéine. Explication: codon start, codon stop et RBS.
Utilisez HMM FGeneB ORFinder et GeneScan
Comparez les résultats et voir la limite des différents modèle de prédiction.
Récupérez la séquence de la protéine. Pour cela utiliser les options des logiciels de prédiction ou utilisez un traducteur protéique de séquence à appliquer à votre séquence. (Translate Tool)
Sauvergardez dans un fichier protéine.txt.
Utilisez HMM FGeneB ORFinder et GeneScan
Comparez les résultats et voir la limite des différents modèle de prédiction.
Récupérez la séquence de la protéine. Pour cela utiliser les options des logiciels de prédiction ou utilisez un traducteur protéique de séquence à appliquer à votre séquence. (Translate Tool)
Sauvergardez dans un fichier protéine.txt.