Analyse d'une séquence ADN


Il faut trouver le cadre de lecture ouvert de lecture (ORF Open Reading Frame) codant votre protéine. Explication: codon start, codon stop et RBS.

Utilisez HMM  FGeneB ORFinder et GeneScan

Comparez les résultats et voir la limite des différents modèle de prédiction.

Récupérez la séquence de la protéine. Pour cela utiliser les options des logiciels de prédiction ou utilisez un traducteur protéique de séquence à appliquer à votre séquence. (Translate Tool)

Sauvergardez dans un fichier protéine.txt.



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