Le motif est un élément structural que l'on retrouve dans tous les membres d'une famille de protéine. Il contient des résidus essentiels à une fonction conservée, pas nécessairement consécutifs, mais assez proches dans la structure 3D, car ils
participent à la même fonction (site actif, ...). Un motif n'a pas de repliement propre.

Ces motifs ont été définis par des alignements multiples de protéines homologues.

Il se caractérise par des Acides Aminés essentiel ayant un rôle dans la structure et donc dans la fonction de la protéine séparés par des acides aminés non conservés et non essentiels.

La connaissance de ces éléments est une aide précieuse à l'annotation des séquences protéiques. En effet, si un motif ou domaine connu est présent sur une séquence protéique dont on ne sait rien, cela peut donner une indication sur sa fonction biologique.

Pour obtenir de plus amples informations sur la fonction de notre protéine, nous allons la comparer aux banques de motifs protéiques.

PROSITE

PFAM

INTERPRO

Comparez les résultats obtenus et interprétez ces résultats.

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