Analyse d'un génome viral


Grâce aux outils et techniques acquises, réalisez l'analyse d'un génome viral que vous venez de séquencer.

Virus.txt

Pour cela localisez les cadres de lecture.

Extraire les protéines et faire une analyse exhaustive des différentes protéines.

Consignez vos résultats dans un fichier excel à remette au professeur.

Ce fichier devra indiquer:

  • Cadre de lecture (+1 +2 +3, -1 -2 -3
  • Position du cadre de lecture sur la molécule ADN (coordonnées)
  • Taille de la protéine, pI, masse
  • Recherche de similarité dans les bases de données (BlastP). reporter la protéine la plus proche, e value, score.
  • Recherche de motifs, peptides signaux et transmembranaires.