Introduction





La phylogénie(ou phylogénèse) est  l'étude de la formation et de l'évolution des organismes vivants en vue d'établir leur lien de parenté.

La phylogénie moléculaire correspond à de la phylogénie par comparaison de gènes ou de protéines.

Un arbre phylogénétique est une représentation graphique de la phylogénèse d’un groupe de taxa réalisé à partir de l’étude d’un ou plusieurs caractères.

On représente couramment une phylogénie par un arbre phylogénétique. Chque branche de l'arbre est nommé taxon et représente un individu.  La proximité des branches de cet arbre représente le degré de parenté entre les taxons. Chaque noeud de l'arbre représente un ancêtre commun ente les taxons

L’homologie implique une origine évolutive commune mais les caractères étudiés peuvent avoir des formes
ou des fonctions différentes.
L’analogie (ou homoplasie) implique une similitude de forme ou de fonction sans qu’il n’y ait d’origine évolutive commune.

Enfin, la xénologie correspond à l’acquisition d’un caractère sans héritage (cas des transferts horizontaux).