{"id":3250,"date":"2012-02-03T10:29:23","date_gmt":"2012-02-03T08:29:23","guid":{"rendered":"http:\/\/www.mathgon.com\/wp\/?p=3250"},"modified":"2012-02-03T10:48:57","modified_gmt":"2012-02-03T08:48:57","slug":"apres-analyse-le-genome-dozzy-osbourne","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mathgon.com\/wp\/apres-analyse-le-genome-dozzy-osbourne","title":{"rendered":"Apr\u00e8s analyse, le g\u00e9nome d’Ozzy Osbourne"},"content":{"rendered":"

Internet, t\u00e9l\u00e9vision, radio, l’info c’est du buzz, de la fast-food de l’info. Vite consomm\u00e9, vite d\u00e9g\u00e9r\u00e9, imm\u00e9diat, mais sans la saveur d’un bon plat. Du coup, j’ai c\u00e9d\u00e9 \u00e0 ce p\u00each\u00e9, l’annonce du s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome d’Ozzy Osbourne<\/a> pour lequel je n’avais donn\u00e9 suite.<\/p>\n

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\u00a0Mat\u00e9riels et m\u00e9thodes<\/h1>\n
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Cofactor Genomics<\/a> a construit et s\u00e9quenc\u00e9 une banque d’ADN g\u00e9nomique \u00e0 partir de cellules d’Ozzy Osbourne. 39 Gb (milliards de lettres) ont \u00e9t\u00e9 s\u00e9quenc\u00e9s, soit une couverture 13x avec un s\u00e9quenceur Applied Biosystems SOLiD 4<\/a>. Les analyses ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9es par Life Technologies<\/a> et Knome<\/a> sous la direction du Dr Nathan Pearson. Elles consistent en une comparaison avec les g\u00e9nomes disponibles<\/strong> dans la NCBI (National Library of Medicine) ainsi qu’avec la la version 18 du g\u00e9nome humain de r\u00e9f\u00e9rence.<\/p>\n

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\u00a0R\u00e9sultats<\/h1>\n
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Sur la base de de l’ADN mitochondrial, Ozzy est apparent\u00e9 \u00e0 quelques parents c\u00e9l\u00e8bres, Stephen Colbert ou Henry \u00abSkip\u00bb Gates. L’ADN d’Ozzy a \u00e9galement r\u00e9v\u00e9l\u00e9 de petites portions de l’ADN de N\u00e9andertal<\/strong>, acquises lors de m\u00e9tissages N\u00e9andertal-sapiens. Mais son c\u00f4t\u00e9 bestial ne vient pas de l\u00e0, George Church le fondateur de Knome a environ 3 fois plus d’ADN n\u00e9andertalien que Ozzy.<\/p>\n

Niveau drogues, six fois plus de risque de d\u00e9pendance \u00e0 l’alcool<\/strong> mais des pr\u00e9dispositions inf\u00e9rieures \u00e0 l’h\u00e9ro\u00efne ou \u00e0 la nicotine. Avec plusieurs bouteilles de cognac par jour pendant des ann\u00e9es, sans trop en \u00eatre \u00e9prouv\u00e9, \u00e7a semble compr\u00e9hensible! Cette capacit\u00e9 \u00e0 ingurgiter d’importantes quantit\u00e9s d’alcool pourrait s’expliquer par une mutation dans la r\u00e9gion r\u00e9gulatrice du g\u00e8ne codant l’alcool d\u00e9shydrog\u00e9nase (ADH4), impliqu\u00e9e dans le m\u00e9tabolisme de l’alcool.<\/p>\n

La d\u00e9couverte la int\u00e9ressante concerne le g\u00e8ne comt<\/em> (cat\u00e9chol-O-m\u00e9thyltransf\u00e9rase). Dans son cas, ce g\u00e8ne est dupliqu\u00e9 en deux variants appel\u00e9s \u00abwarrior<\/strong>\u00a0\u00bb et \u00abworrier<\/strong>\u00bb, \u00abguerrier\u00bb et \u00abinquiet\u00bb. Cette enzyme d\u00e9grade la dopamine, l’adr\u00e9naline et la noradr\u00e9naline. Le variant \u00ab\u00a0guerrier\u00a0\u00bb implique une aptitude \u00e0 la planification, \u00e0 l’organisation ou \u00e0\u00a0 la conscience de soi, alors que le variant \u00ab\u00a0inquiet\u00a0\u00bb d\u00e9pr\u00e9cie ces fonctions.<\/p>\n

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Bien qu’ayant toujours \u00e9t\u00e9 un hypocondriaque, j’ai toujours pens\u00e9 que c’\u00e9tait l’alcool et les drogues qui m’ont fait accomplir toutes ces choses d\u00e9mentes. A certains \u00e9gards je suis une personne anxieuse et qui manque de confiance. C’est peut-\u00eatre dans mes g\u00e8nes car ces deux c\u00f4t\u00e9s de ma personnalit\u00e9 me r\u00e9sument parfaitement. \u00catre un guerrier, le Prince des T\u00e9n\u00e8bres m’a rendu c\u00e9l\u00e8bre. \u00catre inquiet m’a gard\u00e9 en vie alors que certains de mes amis les plus chers n’ont jamais atteint la trentaine.<\/p>\n<\/blockquote>\n

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\u00a0Et alors?<\/h1>\n
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Bien que pr\u00e9sent\u00e9s sous la forme d’une publication, ces r\u00e9sultats ne sont que des facteurs de pr\u00e9disposition<\/strong>, qui plus est issus d’un communiqu\u00e9 de Presse de Knome .<\/p>\n

L’environnement<\/strong>, conditionnant l’expression de ce g\u00e9nome, reste un facteur cl\u00e9 de compr\u00e9hension du vivant. Et parmi les facteurs environnementaux, le microbiote<\/a><\/strong>, symbiose que nous entretenons avec notre flore microbienne. Symbiose, b\u00e9n\u00e9fices mutuels, ce ne sont pas des squatteurs mais une source de g\u00e8ne dont notre organisme ne pourrait se passer. Ces vendeurs de r\u00eaves de la compr\u00e9hension du Soi vont certainement lever certains myst\u00e8res de la curiosit\u00e9 ancestrale de l’homme. C’est beau mais flippant<\/strong>, j’ai peur qu’un jour tout le monde pourrait avoir acc\u00e8s \u00e0 cette intimit\u00e9… Les assureurs se frottent d\u00e9j\u00e0 les mains ! Des r\u00e9seaux sociaux ou de rencontre bas\u00e9 sur les affinit\u00e9s possible, je devrais d\u00e9j\u00e0 d\u00e9poser le nom de domaine Genebook.com!<\/p>\n

Lorsque le business fricote avec le showbusinees, c’est un tremplin pour le march\u00e9 de la g\u00e9nomique personnelle<\/strong> qui est en train de prendre son envol; la diminution du co\u00fbt de s\u00e9quen\u00e7age constituant une v\u00e9ritable rampe de lancement. L’augmentation du d\u00e9bit des s\u00e9quenceurs et la diminution du co\u00fbt par base surclassent largement la loi de Moore, une illustration ici<\/a>. Le march\u00e9 des s\u00e9quenceurs est en pleine \u00e9bullition<\/strong>, les grosses soci\u00e9t\u00e9s lancent des OPA<\/a> pour acqu\u00e9rir les technologies novatrices d\u00e9velopp\u00e9es par des startups . Du c\u00f4t\u00e9 des analyses, trois soci\u00e9t\u00e9s sont dans les starting blocks (Knome<\/a>, Complete Genomics<\/a>, 23andme<\/a>), un g\u00e9nome humain co\u00fbte aujourd’hui 4998$ mais si vous avez 1000$<\/strong> \u00e7a pourrait \u00eatre votre cadeau de No\u00ebl 2012!<\/p>\n

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