Portails

(centralisons les informations)


Les ressources bioinformatiques sont hébergées sur des serveurs centralisés. Cette centralisation permet le croisement de différentes banques de données pour augmenter la quantité (mais pas forcément la qualité) des données recherchées en consultant un unique serveur.

Les serveurs mutualisant les banques de données et permettant de faire des recherches croisées sont nommés portails. Ces portails possèdent également divers outils pour analyser vos séquences et les confronter aux bases de données. Le plus populaire est Blast (chap Alignement), La publication faisant référence est la plus citée au monde...

Cette centralisation n'est que virtuelle, il existe de nombreuses copies de bases de données nommées mirror. Les bases de données sont ainsi sauvegardées.

Pour information, les utilisateurs peuvent également garantir leur anonymat en se connectant par des protocoles de connection sécurisés à certains portails et bases de  données. (Possibilité d'existence d'espionnage informatique  sur les soumissions dans les bases de données... intérets industriels et pharmaceutiques pour l'obtention de brevets par recoupement de séquence, d'adresse IP localisant le lieu de soumission et les résultats obtenus.)

Il existe de nombreux portails

  • Entrez : le plus fréquenté, hébergé au NCBO
    •     GenBank
    •     Pubmed: Ressources bibliographiques
    •     Taxonomy: Centre de ressources taxonomique
    •     Blast
    •     ....
  • EMBL : European Molecular Biology Laboratory
  • Genouest : plateforme bioinformaque du grand Ouest (Visite guidée)