Portails
Les ressources bioinformatiques sont
hébergées sur des serveurs
centralisés. Cette
centralisation permet le croisement de différentes banques
de
données pour augmenter la quantité (mais pas
forcément la qualité) des données
recherchées en consultant un unique serveur.
Les serveurs mutualisant les banques de données et
permettant
de
faire des recherches croisées sont nommés
portails.
Ces portails possèdent également divers outils
pour analyser vos séquences et les confronter aux bases de
données. Le plus populaire est Blast (chap
Alignement), La publication faisant référence est
la plus citée au monde...
Cette centralisation n'est que virtuelle, il existe de nombreuses
copies de bases de données nommées mirror. Les bases de
données sont ainsi sauvegardées.
Pour information, les utilisateurs peuvent également garantir leur anonymat en se connectant par des protocoles de connection sécurisés à certains portails et bases de données. (Possibilité d'existence d'espionnage informatique sur les soumissions dans les bases de données... intérets industriels et pharmaceutiques pour l'obtention de brevets par recoupement de séquence, d'adresse IP localisant le lieu de soumission et les résultats obtenus.)
Il existe de nombreux portails
- Entrez : le plus fréquenté, hébergé au NCBO
- GenBank
- Pubmed: Ressources bibliographiques
- Taxonomy: Centre de ressources taxonomique
- Blast
- ....
- EMBL : European Molecular Biology Laboratory
- Genouest : plateforme bioinformaque du grand Ouest (Visite guidée)