Exercice 2
Ne possédant pas de
reproduction sexuée, la notion d'espèce chez les
microorganismes est très longtemps restée basée
sur des critères morphologiques.
Toujours basé sur la notion d'horloge moléculaire, un marqueur très conservé et présent chez tous les microoragnismes a été choisi en raison de son faible taux de mutation: le gène codant pour la petite sous unité ribosomale 16S: 16SrDNA.
Retracez l'histoire évolutive de ces microorganismes en récupérant les séquences 16S des microorganismes listez ci-dessous (vous pouvez ajouter des séquences d'autres microorganismes si vous le désirez)
Récupérez les
Toujours basé sur la notion d'horloge moléculaire, un marqueur très conservé et présent chez tous les microoragnismes a été choisi en raison de son faible taux de mutation: le gène codant pour la petite sous unité ribosomale 16S: 16SrDNA.
Retracez l'histoire évolutive de ces microorganismes en récupérant les séquences 16S des microorganismes listez ci-dessous (vous pouvez ajouter des séquences d'autres microorganismes si vous le désirez)
Récupérez les
>BapSg | Buchnera aphidicola Sg | |
>BspAPS | Buchnera aphidicola APS | |
>CFT073 | Escherichia coli CFT073 (UPEC) | |
>ECH3937 | Erwinia chrysanthemi 3937 | |
>EcoRIMD | Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) | |
>EDL933 | Escherichia coli EDL933 (EHEC) | |
>MG1655 | Escherichia coli K-12 MG1655 | |
>PluTTO1 | Photorhabdus luminescens TTO1 | |
>PstDC3000 | Pseudomonas syringae DC3000 | |
>Sbo227 | Shigella boydii 227 | |
>SCRI1043 | Erwinia carotovora SCRI1043 | |
>Sdy197 | Shigella dysenteriae 197 | |
>SenChB67 | Salmonella Choleraesuis SC-B67 | |
>SenCT18 | Salmonella Typhi CT18 | |
>SenLT2 | Salmonella Typhimurium LT2 | |
>SenPA9150 | Salmonella Paratyphi_A ATCC9150 | |
>SenTy2 | Salmonella Typhi Ty2 | |
>Sfl2457T | Shigella flexneri 2457T | |
>Sfl301 | Shigella flexneri 301 | |
>Sso046 | Shigella sonnei 046 | |
>Wbrevi | Wigglesworthia brevipalpis | |
>YP91001 | Yersinia pestis 91001 | |
>YPCO92 | Yersinia pestis CO92 | |
>YPKIM | Yersinia pestis KIM | |
>Ypt32953 | Yersinia pseudotuberculosis IP32953 |