Analyse d'une séquence ADN
Un nettoyage de votre séquence sortie du
séquenceur doit être effectuée pour
éliminer le vecteur de clonage.
Utiliser VecScreen
Cet outil est disponible sur Entrez, c'est une version spécialisée de blast avec une base de données de vecteurs de clonage.
Le nettoyage en plus de masquer l'information évite la polution des bases de données par ces séquences contaminantes entrainant des erreurs d'annotation.
Pour voir l'importance de ces contaminations, prenez la séquence de vecteur de clonage que vous venez d'éliminer de votre séquence:
CGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGG
Utiliser VecScreen
Cet outil est disponible sur Entrez, c'est une version spécialisée de blast avec une base de données de vecteurs de clonage.
Le nettoyage en plus de masquer l'information évite la polution des bases de données par ces séquences contaminantes entrainant des erreurs d'annotation.
Pour voir l'importance de ces contaminations, prenez la séquence de vecteur de clonage que vous venez d'éliminer de votre séquence: