Récupérer la séquence de la protéine la plus proche trouvée lors du blastP (Etape6).

Aligner cette séquence et la séquence de votre nouvelle protéine avec ClustalW.

Faites un alignement en gardant les paramètres. Recommencer en variant les parametres (Matrix, Gap open, End gaps, Gap extension et Gap distance). 

! Explication des paramètres !

Ces paramètres sont à affiner en fonction de la distance évolutive suspectée des séquences.

Comparer la qualité des alignements. Lequel semble être le meilleur?

Vos protéines sont elles homologues?

D'après les rappels de  bioinfo, quels sont les recherches à effectuer pour argumenter la fonction supposée de la protéine?