Il faut trouver le cadre de lecture ouvert de lecture (ORF Open Reading Frame) codant votre protéine. Explication.

Utilisez HMM ou FGeneB ou d'autres trouvés sur des portails

Comparez les résultats.

Récupérez la séquence de la protéine. Pour cela utiliser les options des logiciels de prédiction ou utilisez un traducteur protéique de séquence à appliquer à votre séquence. (Translate Tool)

Sauvergardez dans un fichier protéine.txt.